Umfang. Plausible misst Web-Zugriffe. Das ist das ganze Produkt: Besucher, Quellen, Seiten, Ziele, ein Dashboard, das man ohne Schulung lesen kann. Matomo zielt auf Funktionsgleichheit mit Google Analytics (Heatmaps, Sitzungsaufzeichnungen, App-Messung, eigene Berichte, ein Tag-Manager) und ist eine viel größere Sache zu lernen und zu betreiben.
Cookies. Plausible speichert nichts auf dem Gerät des Besuchers, Punkt. Matomo kann so konfiguriert werden und ist es ab Werk nicht. Wenn Ihr Grund, Google Analytics zu verlassen, das Einwilligungsbanner ist, ist dieser Unterschied die ganze Entscheidung: Das eine nimmt die Frage weg, das andere macht sie zu einer Konfiguration, die Sie richtig hinbekommen und richtig halten müssen.
Was der Betrieb Sie kostet. Beide sind quelloffen und beide selbst betreibbar. Sie sind nicht gleich leicht zu betreiben: Matomo ist deutlich das schwerere, und das ist der Preis der Funktionsliste. Plausibles Cloud ist der einfachere Weg und ein Abonnement; selbst betriebenes Matomo ist frei von Lizenzkosten und wird mit Server, Aktualisierungen und Aufmerksamkeit bezahlt.
Geld. Plausible hat keinen kostenlosen Tarif: Sie zahlen vom ersten Tag an, in einem Cloud-Tarif. Matomo ist kostenlos, wenn Sie es selbst betreiben, und wird als Cloud-Tarif verkauft, wenn nicht. „Kostenlos" bedeutet also im selben Satz zwei völlig verschiedene Dinge, und die ehrliche Fassung ist, dass in Matomos kostenloser Möglichkeit die Zeit eines Betreibers steckt.
Apps. Matomo misst mobile Apps. Plausible tut es nicht und behauptet es auch nicht. Wenn installierte Software Teil dessen ist, was Sie verstehen müssen, beendet das den Vergleich für sich allein.